Migren hastalığının nedeni tam olarak bilinmemektedir. Ancak araştırmalara göre beyinde ki kimyasal değişimlere bağlı ortaya çıkmaktadır. Ailesinde migren hastası olan kişilerin yüzde kırk beşi bu hastalığı yaşamaktadır. Hem anne hemde babasında migren olanların ise yüzde yetmiş beşi bu hastalığa sahip oluyor.